实验室、洁净室、无菌室工程、通风柜如何能提供最佳的�；つ芰�，其最主要因素还在于使用人员的正确操作。正确的操作及工作方式，将可以大幅降低污染物外泄之可能性，延长通风使用寿命。
操作前检查，操作人员在启动风机系统后，即可开始使用通风柜，在使用通风柜前需先检视：
1.电源开关是否都处于开启位置；
2.底柜电源控制面板上之电源指示灯是否亮起；
3.日光灯开关是否打开；
4.通风柜是否处于排风状态；当所有检查结果一切正常时方可开始操作通风柜。
通风柜正确操作模式
1.玻璃视窗全开状态仅在组装、调试内部仪器设备或清洁柜内空间时方允许出现，此为『调适状态』；
2.调玻璃视窗开至使用者手肘处（半开），使操作人员手伸入柜内操作实验，而胸部以上则受玻璃视窗安全钢化玻璃所屏护，此为『正常操作状态』；
3.调节门开至最低开度，操作人员离开，使柜内实验程序自行反应或暂停实验，此为『待机状态』；
4.实验人员在通风柜实验进行中时，应避免将头伸入调节门内，以避免危险；
5.通风柜内应避免放置过多非必要物品、器材，以免干扰空气的正常流动，造成扰（湍）流；
6.实验物品、器材放置在通风柜内时，应距离调节门内侧150mm左右，以确保排气之顺畅（ASHRAE-110）
7.操作人员在结束工作，离开通风柜前，应将通风柜内设备电源关闭，并将所有水、电、气开关予以关闭，并将调节门降至最低位置后方可离开；
8.通风柜内虽均为进口高分子耐蚀材料，但为长保如新，延长使用寿命，适当的清洁保养是必要的，平时使用时若有试剂、药品喷溅应即时拭擦、清除，在每天停止工作离去前，应将内部以清水擦拭清洁，每三个月至少一次将导流板卸下清洗检查。
9.通风柜之下柜体，左侧具有通风换气功能可放置试剂；右侧单柜为水、气系统容纳柜，严禁放置任何具腐蚀性物质。
10.每台通风柜设有电路�；は低常ㄈ燃痰缙�+交流接触器双重防护），设总电源用断路器（NFB）一只(附漏电�；�)，对风机、、风阀、灯具及插座实行控制�；�。电源插座仅提供10V220A使用规格，当设备总用电超过10A时，需另行设计；
11.每台通风柜均具杯槽一只，此杯槽系供冷凝水排放，实验需取用水及清洗柜内时排水用，非供洗涤用（通风柜内空间有限，为免水花四处喷溅，影响实验甚至造成危险。特殊需要别行所配水槽）。
设备及材料的正确摆放位置
通风柜内放置装备或仪器时，其摆放位置会影响通风柜内气流形态，当操作人员站在通风柜前方时，会造成一股涡流，而此时如果操作人员之前方物品置放位置不正确时，将会导致这种逆流及扰流的情形加重。（如下图）
通风柜内摆放设备、材料的位置与之相对应的气流效应
设备及仪器摆放建议参考以下方法：
1.器材应尽量于靠通风柜内部深处放置，并应至少距离调节门6至8吋。对碟型台面板之通风柜，装备、器材应置于台面板凸起之边缘后方；
2.以因装备过长而将其伸出调节门外，或置放之位置足以影响调节门之开启或关闭；
3.当放置设备高度超过100 mm时，此设备下方需要有气流通道，可使用不锈钢支架将设备架高，中空型或孔状支架可以降低对气流形态之干扰；
4.应避免在通风柜内置放过多的设备及仪器，在通风柜内的装备或其它设备总面积不得超过台面板面积50%；
5.通风柜内如须使用需用电源之设备或仪器时更应注意，该设备应接地，以降低火花产生之可能性。电源线应从下方进气口处拉出，外接电源插座，电源插座亦应有完善及经过认证的接地设施；
6..柜内有产生高热负载设备，其热源将会造成柜内气流变化，影响通风柜玻璃视窗开口下方之表面风速。热气流会增加玻璃视窗开口下方之表面风速，开口上半部之表面风速降低；
7.由于一般在通风柜内的上方以及调节门的后方都会有逆流及涡流的存在，所以应尽量避免在这两个部位产生大量之气流扰动。
在通风柜内置放会产生危险物质之装备、器材的正确置放位置
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